由美国国立卫生研究院（National Institutes of Health）资金支持的癌症基因组图谱（TCGA）项目的科学家发现了两种第二常见的肾癌的分子特征，并给这种疾病的亚型进行了分类。
每年被诊断的肾癌病例中，乳突性肾细胞癌（PRCC）占到15%-20%，它一直以来被分为1型和2型，直到现在科学家们知道的大多关于PRCC的潜在遗传学的信息都是由极少数遗传疾病中获得的。没有家族遗传史的肾癌病例的分子背景还所知甚少。现在还依然没有对于晚期PRCC的治疗方法。
这些发现描述了1型和2型特殊分子机制的不同，以及2型的3种不同亚型，相关数据被发表在新英格兰医学杂志上。
“PRCC体现了医生面临的一个问题——在一些病人中，这种疾病是无痛的但是却在肾广泛分布。但在一些其他的案例中，却有高度侵略性的个人损伤，”Van Andel Research 研究机构(VARI)的助理教授Hui Shen博士说，“VARI作为TCGA研究网络的一部分，主要负责该项目关键性生物信息的研究。这些发现不但为临床医生提供了基础临床决策十分需要的信息，也为特异性对疾病亚型的靶向治疗打下了很好的基础。”
癌症分类
研究人员通过对161个患者的肿瘤基因组分析，发现1型和2型PRCC在分子机制和基因组上是不同的，应该被认为是两种独立的疾病，它们也发现了2型PRCC中的3种不同的亚型，每种都有不同的分子变异。
DNA甲基化是DNA分子的一种修饰，它调控着基因的开关，当甲基化出错时能导致肿瘤新生。2型PRCC的一种亚型的基因组有成千上万个DNA甲基化或超甲基化的基因，这种亚型被称为CpG岛甲基化表型（CIMP）。在所有PRCC亚型中，它的存活率是最低的，这与一个调控新陈代谢的基因的变异有关。CIMP肿瘤细胞经历一个代改变，为它们的快速生长和存活提供了条件。
Hui Shen博士说：“CIMP的样本与PRCC的早期阶段有关，而且是最容易致死的，用分子标记进一步区分例如CIMP的亚型之间的不同将会给科学家和临床医生更有力的工具，进而精确诊断肿瘤类型，并且发明靶向特异性肿瘤的治疗技巧、方法。”
这项研究也描述了一些肿瘤相关通路的变异，包括MET/VEGRF 和 NRF2/ARE，用于PRCC治疗，靶向MET/VEGRF的药物正在临床试验中，靶向NRF2/ARE的药物近期也被研发出来。
一项大规模的工作
癌症基因组图谱(TCGA)是由美国国立卫生研究院国家癌症研究所和国家人类基因组研究所共同合作的一个项目，旨在通过基因手段全面表征预后不良和对公众健康有重要意义的癌症。TCGA研究网络中的调研者来自全美国的研究所和医学机构，包括Shen ，Peter Laird博士和Stephen Baylin博士。Peter博士是Van Andel 研究机构的教授，在整个研究中负责甲基化数据的收集整理。调查者还包括Stephen Baylin博士，Van Andel 研究机构的教授，约翰霍普金斯大学Sidney Kimmel综合癌症中心癌细胞生物学的联席主管，同时也是乳突状肾细胞癌（PRCC）论文的作者之一。他们共同加入了PRCC项目的来自共计41个机构的调研者队伍中。
作为其中一篇近来具有高度影响力的论文，该文章的发表要归功于TCGA的努力。上个月，TCGA发表了一篇乳腺浸润性小叶癌的综合分析。同样也在今天，该项目的一篇描述前列腺癌的基因机制的论文发表在了《细胞》杂志上。
“TCGA对于癌症研究的作用是不可小觑的，”Laird说，“它证实了数百名科学家之间的大规模合作是如何得到实实在在的结果并共同分享研究成果的。TCGA的数据是公开的，它使该研究领域的每个人都能受益，同时也使患者利用此类信息从而在治疗方法中受益。”
本篇报道中的研究由美国国立卫生研究院的美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所支持，项目编号U24 CA143882。研究内容仅代表作者的观点，由作者负责，不代表美国国立卫生研究院的官方观点。
癌基因组图谱研究网络在 《新英格兰医学杂志》发表“乳头状肾细胞癌的完整分子机制”。
关于VAN ANDEL研究机构
Van Andel 机构（VAI）是一所独立的非营利性的生物医学研究所和科学教育机构，致力于提高当代和后代的健康状况和生命质量。它由Jay和Betty Van Andel1996年在密歇根大急流城建立，目前已成为拥有330多位科学家、教育工作者和其他员工的一所一流研究教育机构。Van Andel 研究机构（VARI）是VAI的研究分部，致力于确定癌症、帕金森和其他疾病的表观遗传学、遗传学、分子机制和细胞机制，并且将研究发现转化为行之有效的治疗方案。该机构的科学家各自在当地实验室的工作，并建立起全球范围内的协作伙伴关系，共同参与研究。
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