表观基因组分析可能导向其它意想不到的发现和许多疾病的新型药物治疗靶点

加州大学圣迭戈分校医学院（Universityof California San Diego School of Medicine）和西奈山伊坎医学院（Icahn School of Medicine at Mount Sinai）的研究者们解码了类风湿性关节炎（RA）的表观基因蓝图。

RA是一种常见的自身免疫疾病，累及130万美国人。在已揭秘的RA表观基因组（即修饰DNA并调节基因开关的蛋白质和分子）中，科学家们获得了意外发现：RA和无法治愈的致命遗传性脑病亨廷顿舞蹈症（Huntington’s disease，HD）的病因存在重叠。这项研究发表于《自然•通讯》（Nature Communications）。

该研究团队由加州大学圣迭戈分校医学院转化医学系主任兼助理副校长、资深作者Gary S. Firestein博士领导，他说，RA和HD之间的意外关联开辟了同时为这两种疾病开发新治疗靶点和药物的可能性。

“我们没有预料到会发现RA和HD之间的重叠，不过发现未知确实是我们开发这项技术的原因。既然我们已经揭示了这种关联，我们希望能因此开启一扇大门，为RA或HD患者带来更多的治疗选择，”Firestein说道。

该研究团队使用的研究方法包括开发一种被称为EpiSig的新型算法或计算法则集，它可以整合并减少RA患者基因中表观基因组合的数量。整合之后，该研究团队能够发现新的细胞信号通路。

“比较不同类型的表观基因组数据是困难的，因为它涉及各种不同的数据子集，这些数据子集通常不能一起分析，包括DNA被修饰的各种方法，”加州大学圣迭戈分校医学院化学、生物化学和细胞分子医学教授Wei Fang博士说道。

“这种方法学可以被用来寻找其它疾病之间的关联，而不仅限于RA，”Firestein补充道，“当相关基因被发现后，研究者们有可能识别出新的治疗措施，甚至扩大现有药物的适应证。”

Firestein及其团队研究了来自RA患者关节的细胞中的表观基因组。以骨关节炎（osteoarthritis，一种软骨退行性变疾病）患者作为对照组。两组数据集都通过一个广泛过程进行了分析，检测了染色质、DNA和组蛋白修饰。分析结果产生了12TB的数据，这些数据随后使用EpiSig进行分析。

表观遗传学是对改变基因结构但不改变DNA序列本身的过程的研究。这些DNA修饰对人类生长、发育和终生变化是至关重要的。表观遗传学改变受各种环境因素的影响，包括应激、活动和生活方式选择。

“通过揭示RA背后全面的表观遗传学，我们现在对该病有了更深入的了解。更重要的是，我们的新方法不仅能够帮助RA患者，还能使其它免疫介导疾病的患者获益，”Firestin说道。

原文标题：

Joint Resolution: A Link Between Huntington’s Disease and Rheumatoid Arthritis

译：林萍萍    校：曹文东